2023-10-19 06:30

尼日利亚金黄色葡萄球菌对不同抗生素耐药性流行情况的荟萃分析

摘要

背景

耐多药金黄色葡萄球菌的迅速出现,给这种菌株引起的感染的治疗带来了困难。本荟萃分析研究的目的是确定尼日利亚金黄色葡萄球菌对不同抗生素耐药的总流行率。

方法

使用谷歌scholar、PubMed、Science direct和African Journal Online进行文献检索。采用MedCalc软件20.0版本的meta-分析比例命令,采用兰德效应模型评估金黄色葡萄球菌对不同抗生素的耐药情况。采用MedCalc中的I2统计量和Egger检验分别评价各研究间的异质性和是否存在发表偏倚。

结果

通过数据库检索,共检索到40,682项研究,其中98项研究符合研究纳入标准。金黄色葡萄球菌对不同抗生素的耐药率从13%到82%不等。结果显示对青霉素G(82%[95%可信区间(CI) 61%, 0.96%])、氯西林(77% [95% CI 64%, 88%])、阿莫西林(74% [95% CI 66%, 81%])、头孢呋辛(69% [95% CI 51%, 85%])、氨苄西林(68% [95% CI 53%, 81%])的耐药程度非常高。中度耐药:红霉素(47% [95% CI 40%, 53%])、氯霉素(47% [95% CI 37%, 56%])、甲氧西林(46% [95% CI 37%, 56%])、氧氟沙星(24% [95% CI 18%, 31%])和利福平24% [95% CI 6%, 48%])。万古霉素低耐药13%(95%可信区间7%,21%)。在每个个体荟萃分析中,观察到高度异质性,在p值≤0.01时,I2范围(79.36-98.60%)。Egger对漏斗图中回归截距的检验表明没有发表偏倚的证据。

结论

这项荟萃分析研究证实,尼日利亚的金黄色葡萄球菌已对常用抗生素产生耐药性,如β -内酰胺类抗生素、磺胺类抗生素、四环素类药物、氯霉素和万古霉素。因此,当务之急是制定规划,促进抗菌药物的合理使用,预防和控制感染,以减少抗菌药物耐药性的发生。

背景

金黄色葡萄球菌(S. aureus)由于其代谢的多功能性和耐药能力,能够很好地适应各种环境。金黄色葡萄球菌定植于皮肤和鼻咽膜作为正常微生物群在健康个体bbb。然而,当它们侵入内部组织或进入血液时,会引起无数有害的感染。金黄色葡萄球菌是一种重要的病原体,参与医院获得性感染和社区获得性感染,引起许多传染病,包括轻度皮肤和软组织感染、骨骼和关节感染、感染性心内膜炎、心血管疾病、骨髓炎、菌血症和致命肺炎,在健康和有基础疾病的个体中都是如此。社区和医院内葡萄球菌感染的高发与耐多药金黄色葡萄球菌的出现同时发生,这使得抗生素治疗无效。

金黄色葡萄球菌在过去几年中对各种抗生素产生了耐药性,特别是对β -内酰胺类抗生素[4]。耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)和耐万古霉素金黄色葡萄球菌(VRSA)的出现构成了严重的全球公共卫生问题。目前,VRSA和MRSA菌株被归类为非常有效和危险的病原体,在缺乏有效治疗方案的情况下,它们可能在全球范围内造成毁灭性的损害[10]。

金黄色葡萄球菌利用的各种耐药机制包括:产生β -内酰胺酶使β -内酰胺类抗生素失活,挤出四环素类抗生素[6]的外排泵,减少大环内酯类抗生素[7]的积累,产生氨基糖苷类修饰酶使氨基糖苷类抗生素失活,改变氟喹诺酮类抗生素DNA旋切酶和拓扑异构酶IV的表达,以及改变青霉素结合蛋白[8]的Mec基因的表达。

在尼日利亚,由于药物滥用、自我用药、缺乏训练有素的医务人员和贫穷等几个因素,耐多药病原体的流行率继续上升。在全世界与抗菌素耐药性持续上升作斗争之际,了解有关抗菌素耐药性的充分数据和信息是相关的,这可以作为制定有效干预措施以遏制抗菌素耐药性危机的基本基础。从文献来看,之前没有对尼日利亚常规使用的不同抗生素的金黄色葡萄球菌耐药性进行meta分析。由于金黄色葡萄球菌引起的各种感染,因此确定尼日利亚金黄色葡萄球菌对各种常规使用抗生素的耐药性的总流行率是相关的。这将有助于改进治疗选择,并使民众了解由于耐多药菌株日益增加而造成的威胁和治疗失败的可能原因。本荟萃分析的目的是确定尼日利亚金黄色葡萄球菌对各种常规使用抗生素耐药的总流行率。

方法

研究设计

采用荟萃分析来评估尼日利亚金黄色葡萄球菌对各种抗生素耐药的患病率,使用仅依赖标题中的金黄色葡萄球菌的适当研究。尼日利亚金黄色葡萄球菌对各种常规使用抗生素的耐药性流行情况是一项全国范围的研究,因为它涵盖了尼日利亚六个地缘政治区域的研究。采用荟萃分析是因为它是尼日利亚金黄色葡萄球菌对常规使用抗生素的耐药性汇总流行率的定量研究。

搜索策略

使用b谷歌scholar、PubMed、ScienceDirect和African Journal online (AJOL)等电子搜索引擎检索2022年3月23日至5月的可用研究。检索时使用葡萄球菌、抗生素耐药性、抗菌药物耐药性、抗菌药物耐药性、耐药性、药敏、尼日利亚等相关关键词。这些关键词在不同的组合(葡萄球菌或金黄色葡萄球菌和抗生素耐药或抗菌耐药或抗菌耐药或耐药和尼日利亚)中使用布尔运算符。还检查了纳入文章的参考文献列表,以确定与本研究相关的研究。

纳入和排除标准

所有检索文章的搜索结果的标题由两位作者独立筛选,目的是包括解决研究问题的研究。将文章插入到Zotero 5.0.95.1版本的参考应用程序中,该应用程序有助于检测重复文章。仅关注金黄色葡萄球菌抗菌素耐药性流行率的研究标题被归类为符合纳入条件的研究。尼日利亚任何州的金黄色葡萄球菌耐药性以及标题中所示仅在尼日利亚进行的研究是纳入的第一标准。然而,集中在许多微生物菌株抗菌素耐药性的研究被排除在外。

一般来说,从预定义标准中选择的检索研究使用纳入标准进行进一步筛选:研究论文和使用横断面设计的研究、使用人体样本的研究、使用临床实验室标准研究所(CLSI)指南进行抗菌药物敏感性试验的研究、以英语写作的研究和全文的研究。

本荟萃分析的排除标准包括:对非人类样本进行的研究、分离株低于20的研究、重复研究、未使用临床实验室标准协会(CLSI)指南进行抗菌药物敏感性试验的研究、未以英文撰写的研究和综述文章。

数据提取

相关资料如作者姓名及发表年份、研究设计、研究地点、临床样本量、分离物来源、每篇研究文章中检测的金黄色葡萄球菌分离物总数、总编号等。对每种抗生素都有耐药性的分离株。在报告了敏感分离株比例的情况下,则第1。金黄色葡萄球菌耐药菌株的数量计算方法为:用100减去敏感性百分比,然后将结果除以100,再乘以总菌株数。然而,在给定耐药分离株比例的情况下,则No。金黄色葡萄球菌耐药菌株比例除以100,再乘以总菌株数,计算金黄色葡萄球菌耐药菌株的数量。公式为:

(1)

为了确定本荟萃分析中所有相关信息的报告,我们遵循了系统评价和荟萃分析首选报告项目(PRISMA)[9](附加文件1:S1)指南。

统计分析程序

本meta分析采用MedCalc 20.0.1版统计软件进行统计分析。使用MedCalc中的荟萃分析比例命令评估金黄色葡萄球菌抗生素耐药的总流行率。总共进行了23项独立的荟萃分析,以评估金黄色葡萄球菌对23种不同抗生素的耐药性的总流行率。在23项不同的荟萃分析中纳入了6至77项研究。使用MedCalc中的I2统计命令来评价纳入研究之间的异质性。随机效应和固定效应是meta分析中估计合并患病率的两种模型。在本研究中,由于纳入的研究具有高异质性的特点,因此采用随机效应模型进行95% ci的meta分析。采用Egger检验评估发表偏倚bb0的存在。

使用Freeman-Tukey双反正弦变换来确保报告的比例接近或等于0和1的研究不被排除。此外,与其他研究相比,报告耐药性患病率异常高的研究,通过删除研究进行敏感性分析。如果在删除一项报告异常高耐药流行率的研究后,综合流行率的点估计值在所有研究合并的总体综合估计值的95% CI范围内,则认为该研究对总体估计值没有显著影响,反之亦然。


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结果

纳入研究的特征

电子数据库的研究检索记录为40,682篇,其中谷歌scholar、AJOL、PubMed和Science Direct分别为35,400篇、2,180篇、1,706篇和1396篇。b谷歌Scholar的文章给出了35,400个结果,其中包括许多不相关或不符合研究目的的研究;因此,他们是从单独的标题中随机筛选的。对标题的筛选将符合全文评估条件的文章数量减少到134篇。在通读全文后,排除了36篇文章(报告了少量分离株和非人类样本分离株)。因此,有98项研究符合本研究的纳入标准(图1)。

图1
figure 1

用于选择和筛选合格研究的PRISMA流程图

共有46,640株金黄色葡萄球菌对不同抗生素耐药,其中23,048株对多种抗生素耐药。分离源包括:鼻部、血液、阴道、耳部、伤口、尿液、咽喉、丘疹、手部和混合样本,采集自有症状患者[61]和无症状患者[37]。86项研究使用原始数据,12项研究使用医院记录。表1总结了每项研究的特征。

表1纳入研究的特征

异质性调查和发表偏倚

所纳入的研究是在尼日利亚的六个地缘政治区进行的;共有98项研究,其中26项来自南南、23项来自西南、20项来自东南、18项来自西北、8项来自中北部和3项来自东北。质量评估(偏倚风险)是根据以下标准进行的:使用CLSI抗生素耐药性评估指南的研究,使用20多个金黄色葡萄球菌分离株的研究,以及使用在进行检测的地区具有足够代表性的样本的研究。采用琼脂扩散法测定所有纳入研究的金黄色葡萄球菌的耐药性水平。在I2为79.36 - 98.60%的meta分析中,每项meta分析均观察到高度异质性;p值≤0.01)。这是由于样本量的巨大差异;一些研究使用了20株菌株,而另一些研究使用了400株菌株,这对每种抗生素的耐药谱产生了影响。此外,在所有的研究中,临床样本和回收的金黄色葡萄球菌分离株的数量都不同,这些差异导致了高度的异质性。更多的研究是在尼日利亚南部(南、西南和东南部)进行的,这导致了高度的异质性。在这些地区的不同医院进行了研究,得出了不同的患病率估计。大多数研究采用随机抽样,收集不同的临床样本。在51项研究中,每位患者收集了一个以上的临床样本,而在47项研究中,每位患者收集了一个临床样本。Egger的回归截距检验给出的p值范围为0.06至0.99,表明没有发表偏倚的证据(附加文件2:S2),遵循Eggers的检验规则,即“p值小于0.05表明存在发表偏倚”。

精准医疗价的金黄色葡萄球菌对不同抗菌剂的耐药性

在本荟萃分析中,金黄色葡萄球菌对23种不同抗生素耐药的总流行率和每项荟萃分析纳入的研究数量汇总于表2。根据药理学分类,金黄色葡萄球菌对尼日利亚常规使用的抗生素的耐药性流行率如下。

表2汇集的压力价的金黄色葡萄球菌尼日利亚对不同抗生素的耐药性

精准医疗电阻价金黄色葡萄球菌利福平(利福平)

对涉及利福平耐药流行率的7项研究进行了分析。尼日利亚金黄色葡萄球菌对利福平的总耐药率为24%(95%可信区间[CI] 6%, 48%)。森林图(利福平)如图2所示。

图2
figure 2

森林样地金黄色葡萄球菌对利福平耐药流行情况

精准医疗的抗性价金黄色葡萄球菌到糖肽(万古霉素)

金黄色葡萄球菌对万古霉素耐药的总流行率为13% (95% CI 7%, 21%),森林样图如图3所示。排除4项研究后的敏感性结果[20,22,27,36],这些研究报道了金黄色葡萄球菌对万古霉素的高耐药率为7% (95% CI 3.3%, 12%)。因此,极患病率显著下降。

图3
figure 3

森林样地金黄色葡萄球菌对万古霉素耐药的流行情况

精准医疗的抗性价金黄色葡萄球菌到-内酰胺类抗生素

估计金黄色葡萄球菌对青霉素类抗生素(青霉素G、甲氧西林、阿莫西林、氯西林、氨苄西林和阿莫西林/钙柳酸)耐药的总流行率。分别根据15、40、22、28和20项研究估计青霉素G、阿莫西林、氯西林、氨苄西林和augmentin的耐药性。青霉素G的总流行耐药率最高,为82% (95% CI 61%, 96%)。对cloxacillin [77% (95% CI 64%, 88%)]、阿莫西林[74% (95% CI 66%, 81%)]、氨苄西林[68% (95% CI 53%, 81%)]和阿莫西林/caluvanic [62% (95% CI 50%, 73%)]耐药。然而,甲氧西林耐药率中等[46% (95% CI 37%, 56%)]。抗生素(甲氧西林和青霉素G)耐药性森林图分别显示在图4和图5中,而阿莫西林、氨苄西林、阿莫西林/克拉维酸和氯西林耐药性森林图分别显示在附加文件3:S3、附加文件4:S4、附加文件5:S5和附加文件6:S6中。

图4
figure 4

森林样地金黄色葡萄球菌耐甲氧西林流行情况

图5
figure 5

森林样地金黄色葡萄球菌对青霉素耐药的流行情况

头孢菌素类抗生素耐药率最高的是头孢呋辛69%(95%可信区间为51%,85%),其次是头孢他啶61%(95%可信区间为46%,75%)。头孢曲松耐药44% (95% CI 34%, 54%),头孢西汀耐药43% (95% CI 31%, 546%)。头孢曲松耐药性森林图见图6,头孢呋辛和头孢西汀耐药性森林图分别见附加文件7:S7和附加文件8:S8。

图6
figure 6

森林样地金黄色葡萄球菌对头孢曲松耐药流行情况

精准医疗金黄色葡萄球菌对氟喹诺酮类药物的耐药价

氟喹诺酮类药物中的三种抗生素(环丙沙星、氧氟沙星和诺氟沙林)被纳入研究。对于环丙沙星,44项研究用于估计总耐药性,25项研究用于氧氟沙星,9项研究用于诺氟沙林。金黄色葡萄球菌对环丙沙星[31% (95% CI 24%, 38%)]、氧氟沙星[24% (95% CI 18%, 31%)]和诺氟西林[33% (95% CI 17%, 52%)]的总耐药率。氧氟沙星耐药森林图见图7,环丙沙星和诺氟沙林森林图见附加文件9:s9和附加文件10:s10。

图7
figure 7

森林样地金黄色葡萄球菌对氧氟沙星耐药流行情况

精准医疗的抗性价金黄色葡萄球菌蛋白质合成抑制剂

可逆性蛋白合成抑制剂四环素耐药率最高[65% 995% CI 56%, 76%],其次是红霉素(大环内酯类药物)[47% (95% CI 40%, 53%)]和氯霉素[47% (95% CI 37%, 56%)]。氨基糖苷类(庆大霉素和链霉素)和lincosamides(克林霉素)的耐药水平相对较低。对链霉素[45% (95% CI 34%, 57%)]、克林霉素[35% (95% CI 23%, 49%)]和庆大霉素[31% (95% CI 25%, 37%)]的总耐药率。氯霉素耐药森林图见图8,四环素、红霉素、庆大霉素、链霉素和克林霉素耐药森林图分别见附加文件11.s11、附加文件12.s12、附加文件13.s13、附加文件14.s14和附加文件15.s15。

图8
figure 8

森林样地金黄色葡萄球菌对氯霉素耐药的流行情况

精准医疗的抗性价金黄色葡萄球菌对antimetabolites

抗代谢物类抗生素耐药程度较高。金黄色葡萄球菌对复方新诺明的总耐药率为66% (95% CI为55%,76%),对甲氧苄啶的总耐药率为55% (95% CI为35%,74%)。复方新诺明耐药性森林图见图9,甲氧苄啶耐药性森林图见附加文件16:S16。

图9
figure 9

森林样地金黄色葡萄球菌对复方新诺明耐药的流行情况

pre的比较价的金黄色葡萄球菌对不同抗生素的耐药性

在本荟萃分析中,金黄色葡萄球菌对不同抗生素的耐药性趋势如图10所示。通过观察,本研究中金黄色葡萄球菌对不同抗生素的耐药率从13%(万古霉素)到82%(青霉素G)不等。

图10
figure 10

尼日利亚金黄色葡萄球菌对不同抗生素的耐药性比较

根据金黄色葡萄球菌对不同抗生素的总耐药率,其耐药顺序依次为万古霉素、氧氟沙星、利福平、环丙沙林、庆大霉素、诺氟西林、克林霉素、头孢西汀、头孢曲松、链霉素、甲氧西林、氯霉素、红霉素、甲氧苄啶、头孢他啶、阿莫西林-克拉维酸、四环素、复方新诺明、氨苄西林、头孢呋辛、阿莫西林、氯西林、青霉素G。



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